国の天然記念物ニホンヤマネを専門に扱う、世界でも珍しい博物館です。清里の森で続けられてきた研究の成果が展示され、冬眠中の姿や巣の作りを知ることができます。清泉寮に隣接していて、ソフトクリームと合わせて立ち寄れます。